2020年5月13日，重庆发布第2号总河长令，剑指“三乱”——关于在全市开展污水乱排、岸线乱占、河道乱建“三乱”整治专项行动的决定。
重庆第2号总河长令明确，对2019年问题整改情况开展“回头看”；重点打击违法排污、超标排污和直排、乱排污水行为；建立完善流域统筹协调和上下游、左右岸联防联控机制，加快推进河流管理信息化；引导社会各界和广大群众共同关心、支持、参与河流管理保护。
相关负责人回应称，重庆市第1号总河长令发布后，有效遏制污水偷排乱排行为，水环境质量显著提升。第2号总河长令是第1号总河长令的延伸、扩展和深化，既护“水”也管好盛水的“盆”，目标是实现水岸同治。
同时，重庆第2号总河长令的的发布，既展现全市上下切实筑牢长江上游重要生态屏障的坚定决心，也将加快解决突出问题，进行专项整治。
要求，分全面排查、强力整治、规范管理三个阶段开展专项整治行动，到2020年底基本实现水质净洁、河道整洁、河面清洁的目标。
重庆第2号总河长令还强调了“公众参与”，支持广大群众可以拨打热线 ，河长制公示牌监督电话，或通过举报信箱、重庆河长制微信公众号等平台投诉举报。
回顾重庆市第1号总河长令——
2019年4月20日，重庆发布第1号总河长令——关于在全市开展污水偷排、直排、乱排专项整治行动的决定。
同样分为三个阶段：全面排查、集中整治、巩固提升。在建立河流问题清单和整改台账的基础上，实现集中打击、联合执法、行政执法与刑事司法联动，全面实施“一河一策”，加快补齐污水管网建设短板，并运用智能化、大数据等手段，建立问题排查、处置、销号全过程管理制度。
相关负责人表示，重庆市希望通过总河长令这种方式，确保河长制工作有成效、社会公众有感受、河流生态环境有改善。而发布总河长令有利于打好打赢全市污染防治攻坚战，压实各级河长的责任，激发全社会力量广泛参与。
重庆市第1号总河长令预期想要实现的目标是，到2020年，城市、乡镇生活污水集中处理率分别达到95%和85%以上；长远通过在加强执法监管和补齐二三级管网建设短板的过程中，逐步建立起建管结合、标本兼治、齐抓共管的工作长效机制。
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